我国洁净煤技术的研究和利用有较大的成果，但是也存在许多的问题，这样一些问题严重限制了洁净煤技术的推广运用。
我国煤矿大量矿井水外排与矿区严重缺水局面并存，每年外排约2.2Gt，我国有约70%的矿区缺水甚至严重缺水，随着煤矿城市社会、经济的迅速发展，煤炭基地的战略西移，水资源的供需矛盾将日趋紧张。许多矿井水含有大量悬浮物及少量有害元素。因此，最大限度地处理和净化矿井水，使之资源化，对减少矿区环境污染、缓解干旱缺水地区用水紧张情况起到积极作用。
目前，主要的矿井水处理方法有混凝沉淀法、电渗析法、反渗透法和中和法。混凝沉淀法大多数都用在处理含悬浮物矿井水;电渗析法和反渗透法用于处理高矿化度矿井水;中和法是处理酸性矿井水最常用的一种方法。
第一，国家加大对洁净煤技术利用和推广的支持力度，最好能在近期出台一些相关的产业政策和规划细则，增强可操作性。
第二，国家在财税政策方面对采用洁净煤技术的企业应给与一定的优惠，还可以参照新能源产业某些补贴标准制定相应的补贴标准，帮企业建设和运行相应的设施，另外，对那些积极采用洁净煤技术的企业，且作出明显环保和能效成果的，可以给与奖励。
第三，由于在煤炭工业部撤消后，洁净煤技术的推广利用涉及到多个主管单位，多龙治水的状态使得下属有些企业有些无所适从，国家可以在相关职能部门抽调人员组成一个统一的技术推广和督导委员会，形成一个洁净煤技术利用和推广的领导核心。
第四，新闻媒体、研究单位和主管部门做好洁净煤技术的宣传和推介工作，同时相关行业组织还可以组织一些研讨会、交流会等形式的交流平台，可以组织相关企业和政府的领导参观学习，做好思想扭转和视野开阔方面的工作。当然，在企业内部，也要组织类似的宣传活动，使得洁净煤概念深入人心。条件可以的话，相关的社会相关团体也能做好在社会大众中的宣传和思想发动工作，形成采用洁净煤技术的社会共识。
第五，国家相关职能部门应该联合起来，组织人员制定统一的技术和市场准入标准，同时，各级人大也应开展相关监督法案的制定工作，适时出台相关的管理法案，使得行业发展做到有法可依，有规可循。
第六，高校和研究机构做好相关研究人才的培养工作，集合优势研究人力资源，做好重点、关键技术的科研攻关，加快国外先进的技术的引进和吸收工作，同时尽量开展自主化设计，提高自身的技术参与能力，为我国洁净煤技术推广运用做好人力资源和技术资源的储备和支撑。
第七，各金融机构，特别是国有的几大银行，应该对企业在洁净煤技术利用和推广方面的借贷给与支持，同时做好引导和资金去向的监管工作。在证券市场，可以允许一部企业发行技术股，把企业融资渠道多面化，广泛化和持久化。同时还可以把洁净煤技术的利用建设和CDM项目的申报结合起来，获取西方减排资金的支持。
根据中研研究院《2023-2028年煤化工行业深度分析及投资战略研究咨询报告》分析得知，我国煤化工行业的供给能力完全能满足下游需求，为我们国家的经济的稳定发展提供能源及原材料的基础保障，2028年中国煤化工市场规模达到34945亿元。
我国洁净煤技术的研究和利用有较大的成果，但是也存在许多的问题，这样一些问题严重限制了洁净煤技术的推广运用。
《中国洁净煤技术九五计划和2010年发展规划》在1997年已被国务院批准，但除此之外，相关的配套细则规划却仍未出台，全国洁净煤技术的推进工作整体上还是显得比较缓慢。
洁净煤技术的推广一方面靠国家政府的强制性推广，另一方面也需要企业自律和自动。目前，企业不愿采用或者采用洁净煤技术不积极，原因之一国家相关产业激励机制尚缺乏，无显著的鼓励政策和金融、税收优惠政策。对公司来说，费力而没有利润的事情是不愿意去做的。
国家煤炭工业部撤销以后，相关职能并入了多个部门。这样造成洁净煤技术推广利用缺乏一个统一的领导机构和核心。各自为政的局面易引起一些洁净煤技术项目重复建设、引进技术消化吸收差、一些需合作的技术或项目又不能很好发展等问题。
洁净煤技术相对投资高、回收期长，不少企业尤其是中小企业难以接受。而一些有能力的企业，在高层对洁净煤技术推广和应用却还未形成一种共识，同期，国家相关职能部门和相关研究机构的宣传推广也没有到位，这些某些特定的程度上影响了洁净煤技术的推广发展。
目前，洁净煤技术涉及到多个角度，多项技术，每种技术都应该有相关的标准体系和市场准入规范，然而，遗憾的是，目前，由于资金和人员的问题，这一部分工作还没有完全开展起来，缺乏统一的标准和规范，同时，国家在立法监督和评价体系建设方面也远未完善，造成洁净煤市场管理紊乱，竞争力不强。
一些急需的技术，如先进的烟气脱硫技术、大型循环流化床技术、PFBC、IGCC、大型气化、煤炭液化等，目前还是处于引进和部分吸收状态，技术的完整吸收和自主化创新设计还未做起来，某些核心技术受制于发达国家。
一般工业化技术的推广应用都要经过研究开发、工业示范和推广应用3个阶段。洁净煤技术投入高、回收期长、重在环境效益。目前国家对这一块市场的融资需求还没有重视起来，多种形式的资金还未进入，筹集资金，促进洁净煤技术产业化成为困扰公司发展的大难题。
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